Molecular Networking

uma importante ferramenta computacional para o processo de identificação metabólica a partir de dados de Espectrometria de Massas de alta resolução

Autores

  • Alexandre da Silva Avincola IFPR - Campus Paranavaí Autor
  • Ana Carolina Arenhardt Tomaza Bialetzki IFPR - Campus Paranavaí Autor
  • Tatyane Caruso Fernandes IFPR - Campus Paranavaí Autor

Palavras-chave:

Ferramenta Computacional, Alta Resolução, Espectometria de Massas, Identificação Metabólica

Resumo

A caracterização de metabólitos através da Espectrometria de Massas de alta resolução tem sido a principal técnica utilizada atualmente. Esta técnica utiliza-se do perfil de fragmentação de um íon para identificá-lo, contudo o processo de identificação dos espectros de fragmentação necessita de comparação com bancos de dados específicos para espectrometria de massas e literatura científica, prolongando o tempo de identificação da substância. O Molecular Networking é uma ferramenta computacional que possibilita a comparação de vários espectros de fragmentação entre si e com bancos de dados simultaneamente, reduzindo o tempo análise dos espectros de fragmentação, agilizando o processo de identificação de metabólitos.

Referências

Bhardwaj, C.; Hanley, L. (2014) Ion sources for mass spectrometric identification and imaging of molecular species, Natural Product Reports, vol. 31, num. 6, p. 756-767.

Bouslimani, A. et al. (2014) Mass spectrometry of natural products: current, emerging and future technologies, Natural Product Reports, vol. 31, num. 6, p. 718-729.

Capriotti, A. L. et al. (2012) Multiclass mycotoxin analysis in food, environmental and biological matrices with chromatography/mass spectrometry. Mass spectrometry reviews, vol. 31, num. 4, p. 466-503.

El-Elimat, T. et al. (2013) High-resolution MS, MS/MS, and UV database of fungal secondary metabolites as a dereplication protocol for bioactive natural products. Journal of Natural Products, vol. 76, num. 9, p. 1709–1716.

Ernst, M. et al. (2014) Mass spectrometry in plant metabolomics strategies: from analytical platforms to data acquisition and processing. Natural Product Reports, vol. 31, num. 6, p. 784-806.

Horai, H. et al. (2010) MassBank: a public repository for sharing mass spectral data for life sciences. Journal of Mass Spectrometry, vol. 45, num. 7, p. 703–714.

Jarmusch, A. K.; Cooks, R. G. (2014) Emerging capabilities of mass spectrometry for natural products. Natural Product Reports, vol. 31, num. 6, p. 730-738.

Lei, Z.; Huhman, D. V.; Sumner, L. W. (2011) Mass spectrometry strategies in metabolomics. Journal of Biological Chemistry, vol. 286, num. 29, p. 25435-25442.

Nguyen, D. D. et al. (2013) MS/MS networking guided analysis of molecule and gene cluster families. Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 110, num. 28, p. E2611-E2620.

Nielsen, K. F. et al. (2011) Dereplication of microbial natural products by LC-DAD-TOFMS. Journal of Natural Products, vol. 74, num. 11, p. 2338–2348.

Saito, K.; Matsuda, F. (2010) Metabolomics for functional genomics, systems biology, and biotechnology. Annual review of plant biology, vol. 61, p. 463-489.

Smith, C. A. et al. (2005) METLIN: a metabolite mass spectral database. Therapeutic Drug Monitoring, vol. 27, num. 6, p. 747–751.

Watrous, J. et al. (2012) From the Cover: PNAS Plus: Mass spectral molecular networking of living microbial colonies. Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 109, num. 26, p. E1743–E1752.

Wishart, D. S. et al. (2013) HMDB 3.0--The Human Metabolome Database in 2013. Nucleic Acids Research, vol. 41, num. D1, p. D801–D807.

Yang, J. Y. et al. (2013) Molecular networking as a dereplication strategy. Journal of Natural Products, vol. 76, num. 9, p. 1686–1699.

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Publicado

12-12-2018

Como Citar

Molecular Networking: uma importante ferramenta computacional para o processo de identificação metabólica a partir de dados de Espectrometria de Massas de alta resolução. (2018). Semana Da Tecnologia Da Informação Do IFPR Campus Paranavaí, 1(1). https://tecnoif.com.br/periodicos/index.php/setif/article/view/91

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